2LifeTechnologies网站 LifeTechnologies公司有个非常实用的在线shRNA设计软件，操作非常方便，而且设计出来的shRNA不再需要到NCBI上Blast，直接可以用的首先打开网站，在TargetDesignOptions处选中shRNA，以Fli1为例，输入Accessionnumber或Nucleotidesequence，其他条件不变下拉到底点击RNAiDesign，然后出现推荐的10。

这项服务包含多个关键步骤设计与合成siRNA或shRNA分子构建表达载体实施细胞转染或病毒包装，以及评估基因沉默效果其目的是帮助科研工作者进行特定基因的功能研究与药物开发我们赫贝致力于为客户提供优质服务，满足客户的需求如有任何需求，请随时联系我们在设计与合成siRNA或shRNA分子阶段，我们将。

摘自百度百科 4 在启动子下游的酶切位点下方紧连一个C，使插入片段和启动子有一定空间间隔以确保转录的发生5 ShRNA目的序列的第一个碱基必须是G以确保RNA聚合酶转录如果选择的目的序列不以G开头，必须在紧连正义链的上游加一个G参考资料htm。

shRNA设计通常建议9个核苷酸环，但GC含量3050%的siRNA效果可能更好设计时，需记住5’和3’非编码区的特殊性，以及合成siRNA可能需要多个靶序列来优化效果同时，负对照必不可少，它应与选中的siRNA序列相同但不与mRNA有同源性，可通过打乱顺序来实现现有一些工具如Qiagen公司的网站提供自动siRNA设计。